科學(xué)家將血漿核小體表觀遺傳標(biāo)記用于結(jié)直腸癌診斷
導(dǎo)言:結(jié)直腸癌是全球常見癌癥,患者死亡率高,腫瘤轉(zhuǎn)移是患者死亡的主要原因,早期篩查和診斷對(duì)于改善患者預(yù)后至關(guān)重要。常規(guī)的檢查方法如腸鏡和組織活檢是侵入性的,過程痛苦且存在風(fēng)險(xiǎn)。因此,需要發(fā)展更有利于臨床開展的結(jié)直腸癌檢測(cè)方法。
結(jié)直腸癌是全球常見癌癥,患者死亡率高,腫瘤轉(zhuǎn)移是患者死亡的主要原因,早期篩查和診斷對(duì)于改善患者預(yù)后至關(guān)重要。常規(guī)的檢查方法如腸鏡和組織活檢是侵入性的,過程痛苦且存在風(fēng)險(xiǎn)。因此,需要發(fā)展更有利于臨床開展的結(jié)直腸癌檢測(cè)方法。
近期,以色列魏茲曼科學(xué)研究所和希伯來大學(xué)研究團(tuán)隊(duì)在《Nature Biotechnology》雜志發(fā)表題為“Multiplexed, single-molecule, epigenetic analysis of plasma-isolated nucleosomes for cancer diagnostics”的文章,開發(fā)了一種基于核小體表觀遺傳標(biāo)記的血液檢測(cè)方法,對(duì)于結(jié)直腸癌診斷可達(dá)到92%的精確度。
核小體是染色體的基本組成單元,由DNA鏈纏繞組蛋白而成,當(dāng)細(xì)胞破裂后,核小體脫落到血液中。血液游離核小體保留了豐富的表觀遺傳信息,為無創(chuàng)液體活檢提供了新思路。該研究運(yùn)用單分子成像方法,可靈敏地在熒光顯微鏡下捕獲核小體表觀遺傳圖譜,通過固相polyT鏈與核小體polyA鏈雜交將其固定在表面,并用表征不同表觀遺傳學(xué)修飾的熒光抗體與之結(jié)合成像。研究人員應(yīng)用該技術(shù)得到33個(gè)健康個(gè)體和63個(gè)結(jié)直腸癌患者血液樣本中組蛋白表觀遺傳修飾和DNA甲基化信息,并檢測(cè)了來自死亡腫瘤細(xì)胞的蛋白質(zhì)生物標(biāo)志物,由此得到多維數(shù)據(jù),使用機(jī)器學(xué)習(xí)分類,整合了上述三類標(biāo)志物的分類模型可高效診斷結(jié)直腸癌。
本研究開發(fā)的檢測(cè)技術(shù)可從小于1mL的血液標(biāo)本中獲取臨床相關(guān)的多維度信息,有望實(shí)現(xiàn)結(jié)直腸癌精準(zhǔn)診斷,并可能拓展應(yīng)用于多種癌癥、自身免疫病和心臟病等疾病的診斷中,成為傳統(tǒng)檢測(cè)方法的補(bǔ)充或替代工具。
論文鏈接:
https://www.nature.com/articles/s41587-022-01447-3
注:此研究成果摘自《Nature Biotechnology》雜志,文章內(nèi)容并不代表本網(wǎng)站的觀點(diǎn)和和立場(chǎng),僅供參考。
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