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俄羅斯科學家參與創(chuàng)建基因組數(shù)據(jù)統(tǒng)一平臺
導言:來自俄羅斯、美國、土耳其和歐洲的科學家開發(fā)了一個Shambhala平臺,可將大量基因活性水平的大數(shù)據(jù)結合起來。該數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建將使科學家能夠將不同實驗中兼容性較差的數(shù)據(jù)結合起來。
來自俄羅斯、美國、土耳其和歐洲的科學家開發(fā)了一個Shambhala平臺,可將大量基因活性水平的大數(shù)據(jù)結合起來。該數(shù)據(jù)庫的創(chuàng)建將使科學家能夠將不同實驗中兼容性較差的數(shù)據(jù)結合起來。此項成果發(fā)表于《分子生物科學前沿》。
該Shambhala平臺可將每個基因表達譜轉換為預定義的通用格式。這樣一來,所有數(shù)據(jù)都被合并到一個矩陣中,其中某些部分就可以進行相互比較。該平臺既可以協(xié)調異構數(shù)據(jù),又考慮到了與正在研究中的基因相關的所有關鍵生物學特征。
科研人員在六個數(shù)據(jù)集上測試了該平臺的性能,其中包含約6800個腫瘤樣本和11100個人體健康組織的基因活性水平信息。測試結果顯示,Shambhala在許多參數(shù)上都優(yōu)于其他方法。
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