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國外科研人員用新計算方法繪制出人體組織詳細圖譜
導言:美國康奈爾大學科研人員開發(fā)出一種無監(jiān)督計算策略UTAG,使用單細胞基因表達譜和細胞位置的組合來定義組織內(nèi)的結(jié)構(gòu)區(qū)域,從而繪制出人體組織詳細圖譜,助力器官與細胞研究。
美國康奈爾大學科研人員開發(fā)出一種無監(jiān)督計算策略UTAG,使用單細胞基因表達譜和細胞位置的組合來定義組織內(nèi)的結(jié)構(gòu)區(qū)域,從而繪制出人體組織詳細圖譜,助力器官與細胞研究。
該方法通常適用于通過高度多路復用的單細胞成像數(shù)據(jù)收集的天然組織環(huán)境中的細胞圖像,其核心是兩個矩陣的組合,這些矩陣表示圖像中存在的每個細胞的表型和位置信息,以生成一個新的特征空間,該空間對空間聚合的表型信息進行編碼。該方法有望加速對器官尺度細胞相互作用的研究,并可為各種疾病提供強大的新診斷策略。相關研究成果發(fā)表于《Nature Methods》期刊。
注:本文摘自國外相關研究報道,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點和立場,僅供參考。
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