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科學(xué)家開(kāi)發(fā)時(shí)空轉(zhuǎn)錄組學(xué)并在亞細(xì)胞水平揭示RNA動(dòng)力學(xué)圖譜

2023/5/15 17:27:23 來(lái)源：科技部生物中心評(píng)論：(0)

導(dǎo)言：細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的時(shí)空調(diào)節(jié)對(duì)細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的正常表達(dá)及細(xì)胞功能至關(guān)重要。然而，由于現(xiàn)有轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法不能同時(shí)獲得時(shí)間和空間數(shù)據(jù)。美國(guó)麻省理工學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了時(shí)空轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，并應(yīng)用于探究RNA的生成、轉(zhuǎn)運(yùn)和降解速率，在亞細(xì)胞水平揭示RNA的動(dòng)力學(xué)圖譜。

　　細(xì)胞轉(zhuǎn)錄組的時(shí)空調(diào)節(jié)對(duì)細(xì)胞內(nèi)蛋白質(zhì)的正常表達(dá)及細(xì)胞功能至關(guān)重要。然而，由于現(xiàn)有轉(zhuǎn)錄組學(xué)方法不能同時(shí)獲得時(shí)間和空間數(shù)據(jù)。美國(guó)麻省理工學(xué)院研究團(tuán)隊(duì)開(kāi)發(fā)了時(shí)空轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)，并應(yīng)用于探究RNA的生成、轉(zhuǎn)運(yùn)和降解速率，在亞細(xì)胞水平揭示RNA的動(dòng)力學(xué)圖譜。該研究成果于近日發(fā)表在《Nature Methods》上，題為：Spatiotemporally resolved transcriptomics reveals the subcellular RNA kinetic landscape。

　　研究人員利用修飾堿基5-乙炔尿苷建立了一種具有單細(xì)胞分辨率且能跨時(shí)間和空間獲得RNA概況的轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)（TEMPOmap）。利用該技術(shù)，研究人員在亞細(xì)胞水平構(gòu)建了多種人類細(xì)胞RNA從轉(zhuǎn)錄、轉(zhuǎn)運(yùn)到降解的動(dòng)力學(xué)圖譜。對(duì)單個(gè)細(xì)胞的RNA動(dòng)力學(xué)參數(shù)進(jìn)行聚類分析，他們提出了“動(dòng)力學(xué)基因簇”。這些基因簇有不同的時(shí)間表達(dá)特征和亞細(xì)胞分布，在功能上也相互獨(dú)立，表明不同功能RNA在細(xì)胞周期內(nèi)被動(dòng)態(tài)調(diào)控。

　　綜上，研究人員建立的時(shí)空轉(zhuǎn)錄組測(cè)序技術(shù)可為精準(zhǔn)研究RNA時(shí)空調(diào)控和發(fā)現(xiàn)新的基因表達(dá)調(diào)控機(jī)制提供工具。

　　注：此研究成果摘自《Nature Methods》期刊原文章，文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場(chǎng)，僅供參考。

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