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德國人工智能拓展冷凍電子斷層掃描應(yīng)用潛力
導(dǎo)言:德國科研團隊開發(fā)了基于人工智能的軟件TomoTwin,實現(xiàn)在低溫電子斷層掃描中精確識別、選擇蛋白質(zhì),取代繁瑣的手工選擇,拓展了冷凍電子斷層掃描(Kryo-ET)的應(yīng)用潛力——有可能破譯生物分子在細胞中的作用方式,從而揭示生命基礎(chǔ)和疾病起源。
德國科研團隊開發(fā)了基于人工智能的軟件TomoTwin,實現(xiàn)在低溫電子斷層掃描中精確識別、選擇蛋白質(zhì),取代繁瑣的手工選擇,拓展了冷凍電子斷層掃描(Kryo-ET)的應(yīng)用潛力——有可能破譯生物分子在細胞中的作用方式,從而揭示生命基礎(chǔ)和疾病起源。
新開發(fā)的TomoTwin通過學(xué)習(xí)能夠?qū)鄬訄D中相似的分子進行篩分歸類。軟件的一個優(yōu)勢是提供了預(yù)先訓(xùn)練的“揀選模式”,通過取消訓(xùn)練步驟,軟件可以在本地計算機運行,過去每張斷層圖像的處理時間在60-90分鐘,現(xiàn)在馬普超級計算機Raven上的處理時間減少到15分鐘。目前,該軟件只能檢測細胞內(nèi)大于150千道爾頓的球狀蛋白或蛋白聚合物,科研團隊希望未來可以擴展到膜蛋白、絲狀蛋白和更小尺寸的蛋白。
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