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中國首個NVIDIA Clara Parabricks基因數(shù)據(jù)分析系統(tǒng)交付
2021/6/11 10:53:11 來源:中國企業(yè)新聞網(wǎng)
導言:2021年6月9日,明碼生物科技宣布其正式啟用NVIDIA Clara Parabricks Pipeline分析軟件用于基因組應用,這是NVIDIA首次在中國交付及實施NVIDIA Clara Parabricks。
6月9日,明碼(上海)生物科技有限公司宣布其正式啟用NVIDIA Clara Parabricks Pipeline分析軟件用于基因組應用,這是NVIDIA首次在中國交付及實施NVIDIA Clara Parabricks。本次合作是雙方在基因測序領域進行開創(chuàng)型技術工作的一部分。
整套Clara Parabricks Pipeline分析軟件是一種加速計算框架,支持使用新一代測序 (NGS) 數(shù)據(jù)的人口、癌癥和 RNA 應用。Parabricks Pipelines 是建立在 NVIDIA 的 GPU 架構之上,支持一系列基因分析工具來處理從測序讀取到變異調用的NGS數(shù)據(jù)。Parabricks Pipelines 技術的引入將為明碼生物科技在測序數(shù)據(jù)分析和多組學數(shù)據(jù)分析等領域帶來顯著的性能提升。
明碼生物科技致力于應用基因技術為科研機構、制藥公司和醫(yī)療機構提供全方位的多組學研究和精準醫(yī)學應用的整體解決方案,并助力合作伙伴推動疾病發(fā)病機制的基礎研究、加速藥物研發(fā)和診斷試劑開發(fā)。同時,明碼生物科技深耕于基因大數(shù)據(jù)領域,曾參與完成了包括GMI在內的多個大型基因組項目。
“在生物信息學領域,算力和算法決定了我們對基因數(shù)據(jù)的理解能力和可獲得能力。近年來,云計算、人工智能、5G技術的快速發(fā)展為基因測序數(shù)據(jù)的存儲、共享、應用提供了更大的可能性!泵鞔a生物科技首席技術官李源博士表示:“明碼生物科技每日產(chǎn)生大量的基因測序數(shù)據(jù),使我們極其關注生物信息學分析加速的領域,如何準確、專業(yè)、快速地處理基因大數(shù)據(jù)是明碼生物科技一直追求的課題。”
在基因3.0時代,基因大數(shù)據(jù)的有效運用將為生命科學領域帶來無限機遇,但普通實驗室計算能力已不足以應付日益龐大的數(shù)據(jù)分析,GPU計算技術的誕生不僅有助于解決數(shù)據(jù)分析瓶頸問題,更為未來包含 AI 和深度學習的實驗室數(shù)據(jù)分析提出了新的方向。NVIDIA 一直很關注健康和生命科學領域并積極布局。Parabricks是一個即用型的GPU加速軟件套件,從整個轉錄組到單細胞分析都適用于群體基因組學的DNA種系變異調用、癌癥基因組學的DNA體細胞變異調用,以及RNA測序項目。Parabricks能夠提供更好的基因組學見解并加速診斷以改善治療結果!
明碼生物科技首席信息官費家俊先生
明碼生物科技首席信息官費家俊先生指出:“基因測序市場規(guī)模的擴展和大量的科研工作讓企業(yè)的IT設施受到了巨大的挑戰(zhàn)。而NVIDIA的出現(xiàn)將一定程度地緩解這些壓力,其GPU計算技術將大大加快測序數(shù)據(jù)的生物信息學分析時間,使我們能夠迅速完成客戶的計算任務,讓客戶更多地關注業(yè)務能力,發(fā)揮數(shù)據(jù)的價值。我相信,新一代互聯(lián)網(wǎng)技術將逐漸滲透到基因行業(yè)之中!薄
NVIDIA基因合作伙伴關系全球總監(jiān)George Vacek博士
NVIDIA基因合作伙伴關系全球總監(jiān)George Vacek博士表示:“明碼生物科技在基因大數(shù)據(jù)領域深耕多年,我們期待與這家創(chuàng)新公司合作,使用NVIDIA Clara Parabricks Pipelines讓基因組醫(yī)學和數(shù)據(jù)分析造福主流醫(yī)學!薄
左起:明碼生物科技首席信息官費家俊先生,NVIDIA醫(yī)療行業(yè)銷售總監(jiān)趙文雄先生
明碼生物科技與NVIDIA的合作代表著生物技術和信息技術的融合發(fā)展,推動生命科學從“實驗驅動”向“數(shù)據(jù)驅動”轉型發(fā)展。明碼生物科技和NVIDIA 共同努力,通過強大的資源整合,為基因組學產(chǎn)業(yè)鋪就一條新的IT高速公路,讓未來變得更健康和美好。
關于明碼生物科技
明碼生物科技是中國多組學研究領域的引領者,承接基因組學、轉錄組學和蛋白組學等相關業(yè)務,致力于運用高品質數(shù)據(jù)和應用產(chǎn)品服務于精準醫(yī)學,改善人類健康。
明碼生物科技擁有國際標準化組織 ISO15189 認證的實驗室,作為一體化基因研發(fā)應用和賦能平臺,支持云端及線下使用。
明碼生物科技立足于中國上海及周邊地區(qū),為科研機構、制藥公司和醫(yī)療機構提供全方位的多組學研究和精準醫(yī)學應用的整體解決方案,并助力合作伙伴推動疾病發(fā)病機制的基礎研究、加速藥物研發(fā)和診斷試劑開發(fā),現(xiàn)已在遺傳罕見病、輔助生殖、病原宏基因、腫瘤檢測等臨床應用場景樹立多個品牌。
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