我國科學(xué)家發(fā)現(xiàn)與多發(fā)性硬化癥相關(guān)的新基因
導(dǎo)言:近期,四川大學(xué)華西醫(yī)院、成都醫(yī)學(xué)院第三附屬醫(yī)院與海南省人民醫(yī)院的一項(xiàng)聯(lián)合研究發(fā)現(xiàn),SHMT1,F(xiàn)AM120B和ICA1L基因可能與MS的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。研究成果發(fā)表在《Annals of Clinical and Translational Neurology》期刊,標(biāo)題為“Brain proteome-wide association study linking-genes in multiple sclerosis pathogenesis”。
多發(fā)性硬化癥(MS)是一種慢性炎癥性、脫髓鞘的中樞神經(jīng)系統(tǒng)退行性疾病,影響了全球超過230萬人。由于MS的臨床特征不同且現(xiàn)有治療效果差,因此鑒定MS的生物標(biāo)志物以幫助早期診斷和治療非常重要。近期,四川大學(xué)華西醫(yī)院、成都醫(yī)學(xué)院第三附屬醫(yī)院與海南省人民醫(yī)院的一項(xiàng)聯(lián)合研究發(fā)現(xiàn),SHMT1,F(xiàn)AM120B和ICA1L基因可能與MS的發(fā)病機(jī)制有關(guān)。研究成果發(fā)表在《Annals of Clinical and Translational Neurology》期刊,標(biāo)題為“Brain proteome-wide association study linking-genes in multiple sclerosis pathogenesis”。
研究人員利用全蛋白質(zhì)組關(guān)聯(lián)研究(PWAS),將MS全基因組關(guān)聯(lián)研究(GWAS)數(shù)據(jù)與背外側(cè)前額葉皮層(dlPFC)兩個(gè)不同的人腦蛋白質(zhì)組數(shù)據(jù)進(jìn)行整合,從而識(shí)別出通過影響腦蛋白豐度而導(dǎo)致MS風(fēng)險(xiǎn)的基因。首先,研究人員利用ROSMAP數(shù)據(jù)集中的376例dlPFC樣本的蛋白質(zhì)數(shù)量性狀位點(diǎn)(pQTL)數(shù)據(jù),整合已有的MS GWAS結(jié)果,通過PWAS鑒定出51個(gè)順式調(diào)節(jié)腦蛋白水平的基因。其次,使用相同的WS GWAS數(shù)據(jù)與Banner數(shù)據(jù)集中的152例樣本的pQTL數(shù)據(jù)整合分析,與前面發(fā)現(xiàn)的51個(gè)基因相比較,18個(gè)基因得到驗(yàn)證。接下來,通過貝葉斯共定位分析發(fā)現(xiàn)了6個(gè)與MS有因果關(guān)系的風(fēng)險(xiǎn)基因。最后,差異表達(dá)分析發(fā)現(xiàn)SHMT1和FAM120B在白質(zhì)病變區(qū)域均上調(diào),ICA1L在灰質(zhì)病變區(qū)域下調(diào)。
該項(xiàng)研究為MS的發(fā)病機(jī)制提供了新的見解,并為未來的治療提供了潛在的靶標(biāo)。
論文鏈接:
https://onlinelibrary.wiley.com/doi/10.1002/acn3.51699
注:此研究成果摘自《Annals of Clinical and Translational Neurology》期刊原文章,文章內(nèi)容不代表本網(wǎng)站觀點(diǎn)和立場,僅供參考。
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